Project information
Struktura a dynamika biopolymerů
- Project Identification
- MUNI/A/1533/2018
- Project Period
- 1/2019 - 12/2019
- Investor / Pogramme / Project type
-
Masaryk University
- Grant Agency of Masaryk University
- Category A
- MU Faculty or unit
-
Faculty of Science
- prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc.
- Michelle Almeida da Paz
- Raghib Ashraf
- Christelle Beaumont, M.Sc.
- Mgr. Bc. Kateřina Beková
- Mgr. Kateřina Bendová, Ph.D.
- Krishnendu Bera
- Mgr. Ján Bíňovský
- Mgr. Tomáš Bouchal, Ph.D.
- Mgr. Pavel Brázda, Ph.D.
- Mgr. Tomáš Brom
- Mgr. David Buchta, Ph.D.
- Mgr. Ivana Cavallin, Ph.D.
- Helena Covelo Molares, Ph.D.
- Rahul Deb, M.Sc.
- Mgr. Alžbeta Dikunová
- Mgr. Matúš Durec, Ph.D.
- Mgr. Ivo Durník, Ph.D.
- Mgr. Šimon Džatko, Ph.D.
- Bilal El Kerdi
- Francesco Luca Falginella, Ph.D.
- doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
- Mgr. Martin Gajarský, Ph.D.
- RNDr. Stanislav Geidl, Ph.D.
- Ilektra-Chara Giassa, Ph.D.
- Mgr. Tomáš Gregor, Ph.D.
- Mgr. Zuzana Hammerová
- Mgr. Václav Hejret
- Mgr. Alena Hofrová
- Mgr. Miroslav Homola
- Mgr. Vladimír Horský, Ph.D.
- Mgr. Dominik Hrebík, Ph.D.
- Aliaksei Chareshneu, Ph.D.
- Mgr. Pavel Janoš, Ph.D.
- Mgr. Zuzana Jaseňáková, Ph.D.
- Atis Jekabsons
- Mgr. Ivo Kabelka, Ph.D.
- Tomasz Kabzinski, Ph.D., M.Sc.
- Aiste Kasiliauskaite, Ph.D.
- Anzer Khan, Ph.D., M.Sc.
- Mgr. Veronika Klápšťová
- prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc.
- Mgr. Marek Korsák
- Mgr. Aneta Kozeleková
- Mgr. Daniel Krafčík, Ph.D.
- Mgr. Michaela Krafčíková, Ph.D.
- doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D.
- Mgr. Vojtěch Kubáň, Ph.D.
- RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D.
- Jitender Kumar
- Mgr. Peter Kyseľ
- Mgr. Kateřina Linhartová
- Mgr. Petr Louša, Ph.D.
- Mgr. Markéta Makovická
- prof. RNDr. Radek Marek, Ph.D.
- Mgr. Filip Melicher
- Mgr. et Mgr. Adam Midlik, Ph.D.
- Tarakaramji Moturu, Ph.D.
- Mgr. Klaudia Mráziková, Ph.D.
- Liya Mukhamedova, Ph.D.
- Subhash Narasimhan
- Mgr. Simona Notová
- Magdaléna Novotná
- Ing. Joanna Oniskiewicz, M.Sc.
- Anna Papageorgiou, Ph.D., MSc
- MVDr. Eva Paulenová, Ph.D.
- Mgr. Kateřina Peterková, Ph.D.
- Mgr. Jitka Plucarová
- RNDr. Mgr. Pavlína Pokorná, Ph.D.
- Mgr. Martin Polák
- RNDr. David Sehnal, Ph.D.
- Huma Shakoor, M.Phil.
- RNDr. Ondřej Schindler, Ph.D.
- prof. RNDr. Petr Skládal, CSc.
- prof. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc.
- Mgr. Pavla Suchánková
- doc. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D.
- Mgr. Marta Šiborová, Ph.D.
- Mgr. Tomáš Šikorský
- Mgr. Pavel Šmak
- prof. RNDr. Jiří Šponer, DrSc.
- prof. Mgr. Richard Štefl, Ph.D.
- Ing. Oliver Taltynov
- Bc. Ravi José Tristão Ramos
- Mgr. Zuzana Trošanová, Ph.D.
- Mgr. Dávid Tužinčin
- prof. RNDr. Robert Vácha, PhD.
- Ing. Lucie Valentová
- prof. Mgr. Štěpánka Vaňáčová, Ph.D.
- Nandan Mysore Varadarajan, Ph.D. M.Sc.
- Dragana Vukić, M.Sc.
- prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D.
- Mgr. David Zapletal
- Mgr. Vojtěch Zapletal, Ph.D.
- Zhengyue Zhang, MSc.
- Mgr. Dagmar Zigáčková, Ph.D.
- prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D.
Projekt je zaměřen na integraci 3D strukturních informací popisujících velké makromolekulární struktury - bílkoviny, nukleové kyseliny a jejich komplexy - do funkčního kontextu s cílem porozumět životně důležitým procesům na buněčné úrovni. Pro studium bude využita celá řada experimentálních metod s velkým rozsahem prostorového rozlišení (rentgenové difrakce monokrystalů, nukleární magnetická rezonance, kryo-elektronová mikroskopie a mikroskopie atomových sil) společně s metodami poskytujícími informace o mezimolekulárních interakcích. Pro pochopení základních principů rozpoznávání molekul v živých organismech budou důležité systematické studie in-vitro za využití široké řady biofyzikálních nástrojů. Experimentální přístup bude doplněn teoretickými studiemi využívajícími výpočetní chemii, chemoinformatiku a strukturní bioinformatiku. Součástí projektu bude i vývoj moderních metod strukturní biologie a extrakce molekulárních dat důležitých pro biochemické a biomedicínské aplikace. Řešení jednotlivých cílů projektu se budou účastnit výzkumné týmy, jejichž podstatnou částí jsou studenti magisterských a zejména doktorských studijních programů garantovaných ústavem Národní centrum pro výzkum biomolekul.
Publications
Total number of publications: 3
2019
-
Complex Portal 2018: extended content and enhanced visualization tools for macromolecular complexes
Nucleic acids research, year: 2019, volume: 47, edition: D1, DOI
-
Microbe-focused glycan array screening platform
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, year: 2019, volume: 116, edition: 6, DOI
2018
-
Structure and properties of AB21, a novel Agaricus bisporus protein with structural relation to bacterial pore-forming toxins
Proteins : structure, function, and genetics, year: 2018, volume: 86, edition: 9, DOI