Uplatnění manuální chromatografické separace permethylovaných N-glykanů přítomných v sérech pacientek s nádorem vaječníků
| Authors | |
|---|---|
| Year of publication | 2015 |
| Type | Conference abstract |
| MU Faculty or unit | |
| Citation | |
| Description | Rakovina vaječníků je druhým nejčastějším onkogynekologickým onemocněním s nejvyšší úmrtností. V současné době léčba onemocnění spočívá v chirurgickém odstranění nádoru, chemoterapii a radioterapii. Při chemoterapii se využívají platinové deriváty, na které často při léčbě vzniká rezistence. Je známo, že glykanové struktury mohou informovat o biologických i biochemických dějích v organizmu a mohou indikovat přítomnost a průběh onemocnění. Lze tedy předpokládat, že změny v glykanových profilech sér odebraných před chemoterapeutickou léčbou by mohly pomoci k predikci rezistence pacientek na tuto léčbu. Pro experiment bylo použito 2,5 ul séra, ve kterém byly denaturovány proteiny a purifikovány, redukovány a permetylovány glykany. Část vzorku byla měřena bez separace hmotnostním spektrometrem MALDI-TOF/TOF (Applied Biosystems). Druhá část byla separována přes 1 cm kolonku naplněnou reverzní fází (Aeris peptide C18 3,6µm částice)1. Jednotlivé frakce byly sbírány na MALDI destičku a po převrstvení matricí měřeny za stejných podmínek. Spektra byla upravena v programu Data Explorer použitím funkcí: Baseline Correction, Noise/Smooth filter a porovnána s databází glykanů2. Výsledky měření ukázaly možnost separace permethylovaných glykanů na reverzní fázi. Ve frakcích po manuální chromatografické separaci bylo v hmotnostních spektrech patrné lepší rozdělení a detekován vyšší počet jednotlivých glykanů a dále došlo ke zvýšení intenzit píků v m/z rozsahu nad 3500. |