Regression Algorithm for Identification of Biomarker Areas in SELDI-TOF Mass Spectra

Varování

Publikace nespadá pod Lékařskou fakultu, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Autoři

KNÍŽEK Jiří BOUCHAL Pavel VOJTĚŠEK Bořivoj NENUTIL Rudolf BERÁNEK Ladislav KUBA Martin TOMŠÍK Pavel

Rok publikování 2014
Druh Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj International Journal of Imaging and Robotics
Fakulta / Pracoviště MU

Přírodovědecká fakulta

Citace
www URL
Obor Obecná matematika
Klíčová slova Markers; molecular biology; mass spectra; gnostics; supercomputer.
Popis We describe a special regression algorithm for the identification of biomarker areas in SELDI-TOF mass spectra in this paper. Tests in a set of orthogonal polynomial regressions is the basic principle of this approach. Gnostic cluster analysis is then a very effective algorithmic complement, especially, for a case of excessive behavior of a part of (bio)markers. Apart from this another a new way of TIC-normalization of data is proposed in this paper. This new regression algorithm averages results significantly more effectively than software systems used. A very considerable amount of computation was made on a supercomputer.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.

Další info