Automatic Detection and Segmentation of Exosomes in Transmission Electron Microscopy

Varování

Publikace nespadá pod Lékařskou fakultu, ale pod Fakultu informatiky. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Autoři	ŠTĚPKA Karel MAŠKA Martin PÁLENIK Jakub Jozef POSPÍCHALOVÁ Vendula KOTRBOVÁ Anna ILKOVICS Ladislav KLEMOVÁ Dobromila HAMPL Aleš BRYJA Vítězslav MATULA Pavel
Rok publikování	2016
Druh	Článek ve sborníku
Konference	Computer Vision -- ECCV 2016 Workshops: Amsterdam, The Netherlands, October 8-10 and 15-16, 2016, Proceedings, Part I
Fakulta / Pracoviště MU	Fakulta informatiky
Citace
www	http://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-46604-0_23
Doi	http://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-46604-0_23
Obor	Informatika
Klíčová slova	Exosome; Detection; Segmentation; Transmission electron microscopy; Image processing
Popis	We presented a morphological method for automatic detection and segmentation of exosomes in transmission electron microscopy images. The exosome segmentation was carried out using morphological seeded watershed on gradient magnitude image, with the seeds established by applying a series of hysteresis thresholdings, followed by morphological filtering and cluster splitting. We tested the method on a diverse image data set, yielding the detection performance of slightly over 80 %.
Související projekty:	Automatizovaná analýza elektronmikroskopických snímků pro použití v biologii a medicíně Rozsáhlé výpočetní systémy: modely, aplikace a verifikace V.