Conformational Transitions of Flanking Purines in HIV-1 RNA Dimerization Initiation Site Kissing Complexes Studied by Charmm Explicit Solvent Molecular Dynamics

Varování

Publikace nespadá pod Lékařskou fakultu, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Název česky	Konformační přechody volných purinů v HIV-1 RNA kissing complexech studovaných molekulově dynamickými simulacemi v explicitním solventu pomocí Charmmu
Autoři	SARZYNSKA Joanna REBLOVA Kamila SPONER Jiri KULINSKI Tadeusz
Rok publikování	2008
Druh	Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj	Biopolymers
Fakulta / Pracoviště MU	Přírodovědecká fakulta
Citace
Obor	Biofyzika
Klíčová slova	molecular dynamics methods; RNA
Popis	Studium volných bází v kissing komplexech RNA pomocí silového pole Charmm ukazuje shodu s experimenty prováděnými pomocí Amberu a s rentgenovou krystalografií. Studie popisuje množství konformací, které mohou volné báze zaujmout na nanosekundové časové škále.
Související projekty:	Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím