Projekt Mendelova muzea MU je zaměřen na vyhledávání sbírek a rozvoj péče o předměty, přírodniny a lidské artefakty, které jsou v držení univerzity, často jako produkty vlastního výzkumu studentů a vědeckých pracovníků. Projekt si klade za cíl vyhledat potencionální sbírky, připravit koncepci s jejich nakládáním a prezentovat je jako možné prvky vzdělávání studentů na MU, ale i mimo ni. Projekt se zaměřuje na studenty, kteří by měli aktivně vyhledávat sbírky na MU. Na základě typu sbírek vznikne koncepce pro nakládání sbírek na fakultách a jejich využití při výuce. Vedoucí projektu a administrátoři připraví výstavu ukazující část sbírek a připraví tiskoviny, které budou k dispozici na jednotlivých pracovištích starající se o sbírky.