Project information
A variety of TP53 aberrant states in the clinical and biological behavior of chronic lymphocytic leukemia cells

Funkční heterogenita defektů genu TP53, spočívající v typu defektu jednotlivých alel, proporci aberace a genetickém pozadí, komplikuje interpretaci jejich dopadu v nádorech. V projektu využijeme poznatky získané během 20 let analýz TP53 u chronické lymfocytární leukémie (CLL), kde je přítomnost aberací TP53 klinicky významná. Budeme studovat heterozygotní mutace TP53, jež jsou u nádorů považovány za málo časté, ale u CLL jsou rozšířené. Ověříme, zda postihují skutečně pouze jednu alelu a budeme sledovat jejich funkční dopad in-vitro a in-vivo. Budeme analyzovat genetický kontext defektů TP53 a identifikovat společně se vyskytující či vzájemně se vylučující aberace, jež mohou ovlivňovat klonální kompetici. Dále plánujeme vytvořit dosud největší soubor variant TP53 nalezených v evropských laboratořích u pacientů s CLL a identifikovat a funkčně analyzovat varianty s nejasným dopadem. Funkčně charakterizovaný soubor variant bude veřejně zpřístupněn. Výsledky budou přenositelné do dalších diagnóz, u nichž role TP53 defektů nabývá na významu se širším využíváním sekvenování nové generace.