Project information
Characterising the regulatory mechanisms at decoy 5’ splice sites

Project Identification
GF24-11219K
Project Period
4/2024 - 3/2027
Investor / Pogramme / Project type
Czech Science Foundation
MU Faculty or unit
Faculty of Medicine
Cooperating Organization
National Institute of Chemistry

V posledních letech se ukázalo, že kryptická místa sestřihu mohou hrát důležitou roli při regulaci sestřihu RNA, a zprostředkovaně i celé genové exprese. Mnoho takových regulačních míst je třeba ještě objevit a prozkoumat mechanismy jejich působení. Tento projekt je zaměřen na tzv. decoy 5' sestřihová místa (d-5'ss). Ta obsahují konsenzuální sekvenci 5' sestřihových míst a umožňují sestavení spliceosomu. Budou zkoumány dva hypotetické způsoby jejich působení. Pokusíme se určit podíl d-5'ss, které sestavují neproduktivní spliceozomální komplexy, které soutěží s rozpoznáváním blízkých kanonických sestřihových míst a zpomalují jejich sestřih. Zadruhé určíme typy d-5'ss, které jsou štěpeny prostřednictvím sestřihové reakce, ale výsledná RNA je poté degradována. V poslední řadě budeme zkoumat vliv reprezentativních d-5'ss na dynamiku exprese a lokalizaci transkriptů produkovaných z odpovídajících genů během diferenciace neuronů.

Sustainable Development Goals

Masaryk University is committed to the UN Sustainable Development Goals, which aim to improve the conditions and quality of life on our planet by 2030.

Sustainable Development Goal No.  3 – Good health and well-being Sustainable Development Goal No.  5 – Gender equality Sustainable Development Goal No.  17 – Partnerships for the goals

You are running an old browser version. We recommend updating your browser to its latest version.

More info