Hostitelský mikrobiom ve vztahu k rozvoji Barrettova jícnu a adenokarcinomu jícnu
- Kód projektu
- NU20-03-00126
- Období řešení
- 5/2020 - 12/2023
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo zdravotnictví ČR
- Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2020 - 2026
- Podprogram 1 - standardní
- Fakulta / Pracoviště MU
- Lékařská fakulta
- Další fakulta/pracoviště MU
- Středoevropský technologický institut
- Spolupracující organizace
-
Fakultní nemocnice Olomouc
- Odpovědná osoba Doc. MUDr. Ondřej Urban, Ph.D.
- Odpovědná osoba MUDr. Tomáš Haruštiak, Ph.D.
- Odpovědná osoba prof. MUDr. Robert Lischke, Ph.D.
- Odpovědná osoba Štěpán Hlava
- Odpovědná osoba doc. MUDr. Vladimír Procházka, Ph.D.
- Odpovědná osoba prof. MUDr. Zdeněk Kala, CSc.
- Odpovědná osoba doc. MUDr. Radek Kroupa, Ph.D.
- Odpovědná osoba MUDr. Tomáš Grolich, Ph.D.
- Odpovědná osoba doc. MUDr. Lumír Kunovský, Ph.D.
- Odpovědná osoba Zdeněk Pavlovský
- Odpovědná osoba doc. MUDr. Jiří Dolina, Ph.D.
Hostitelský mikrobiom spolu s genetickou predispozicí jedince jsou důležitými faktory
v etiopatogenezi refluxní choroby jícnu (GERD), která významně zvyšuje riziko rozvoje ezofagitidy (RE), Barrettova jícnu (BE) a adenokarcinomu ezofagu (EAC). Cílem projektu je determinace markerů na úrovni mikrobiomu, genů hostitele a jejich interakcí pro časnější diagnostiku a predikci rozvoje BE a EAC.
Projekt obsahuje 3 části: (1) analýzu metagenomu a metatranskriptomu v několika lokalitách
gastrointestinálního traktu (GIT) u pacientů s GERD, (2) analýzu hostitelského exomu a transkriptomu ve tkáni jícnu u pacientů s BE/EAC, a (3) analýzu genetického profilu pacientů s GERD a jeho komplikacemi. Mutace v exomu/genomu pacienta a míra exprese genů ve tkáni jícnu budou korelovány s mikrobiomem a jeho funkční aktivitou v GITu a klinickým nálezem doplněným o in vivo endomikroskopii.
Na základě získaných dat se pokusíme navrhnout modifikaci standardního režimu péče o pacienty s GERD s cílem předejít pokročilým a ireverzibilním změnám snižujícím kvalitu života pacientů, resp. ohrožujících je na životě.
Publikace
Počet publikací: 19
2022
-
Achalasia and acromegaly: co-incidence of these diseases or a new syndrome?
Biomedical Papers, rok: 2022, ročník: 166, vydání: 2, DOI
-
CYP2C19 Gene Profiling as a Tool for Personalized Stress Ulcer Prophylaxis With Proton Pump Inhibitors in Critically Ill Patients-Recommendations Proposal
Frontiers in Medicine, rok: 2022, ročník: 9, vydání: July 2022, DOI
-
Helicobacter analysis in gastric mucosa samples – comparison of two methodical approaches
Rok: 2022, druh: Konferenční abstrakty
-
Lack of Association between Epidermal Growth Factor or Its Receptor and Reflux Esophagitis, Barrett’s Esophagus, and Esophageal Adenocarcinoma: A Case-Control Study
Disease Markers, rok: 2022, DOI
-
Pharmacogenetics of proton pump inhibitors and prevalence of the CYP2C19*2 and *17 variants in the Central European population
Rok: 2022, druh: Konferenční abstrakty
-
Specific carbohydrate substrates affected the growth of Bacillus cereus strain isolated from an environmental sample
Rok: 2022, druh: Konferenční abstrakty
-
The Use of Confocal Laser Endomicroscopy in Diagnosing Barrett’s Esophagus and Esophageal Adenocarcinoma
Diagnostics, rok: 2022, ročník: 12, vydání: 7, DOI
2021
-
Autoimmune Diseases of Digestive Organs - A Multidisciplinary Challenge: A Focus on Hepatopancreatobiliary Manifestation
Journal of Clinical Medicine, rok: 2021, ročník: 10, vydání: 24, DOI
-
Elevated epidermal growth factor receptor levels in Barrett’s esophagus
Rok: 2021, druh: Konferenční abstrakty
-
Helicobacter pylori infection and other bacteria in pancreatic cancer and autoimmune pancreatitis
World Journal of Gastrointestinal Oncology, rok: 2021, ročník: 13, vydání: 8, DOI