Novel Evolutionary Lineages Revealed in the Chaetothyriales (Fungi) Based on Multigene Phylogenetic Analyses and Comparison of ITS Secondary Structure
| Název česky | Nové evolučními rodokmeny Odhalení v Chaetothyriales (houby) na základě analýz multigenních fylogenetických a srovnání jeho sekundární struktury |
|---|---|
| Autoři | |
| Rok publikování | 2013 |
| Druh | Článek v odborném periodiku |
| Časopis / Zdroj | PloS ONE |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| www | http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0063547 |
| Doi | http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0063547 |
| Obor | Onkologie a hematologie |
| Klíčová slova | Cyphellophora and Phialophora; Chaetothyriales |
| Popis | Cyphellophora a Phialophora (Chaetothyriales, Pezizomycota) zahrnují druh známý z kožních infekcí lidí a zvířat a z různých ekologických zdrojů. Tyto houby byly studovány na základě srovnání kulturních a morfologické rysy a fylogenetické analýzy pěti jaderných lokusů, tj. vnitřní přepisována spacer rDNA operonu (ITS), velké a malé podjednotky jaderné ribozomální DNA (rDNA nuc28S, nuc18S rDNA), beta-tubulinu , replikace DNA licencí faktor (mcm7) a druhé největší podjednotka RNA polymerázy II (rpb2). Fylogenetických výsledky byly podporovány srovnávací analýzy ITS1 a ITS2 sekundární struktury zástupců Chaetothyriales a identifikace substitucí mezi analyzovaného taxonů. Párů bází s non-konzervativních, co se vyvíjející nukleotidů, které udržují párování bází v RNA transkriptu a jedinečné evoluční motivy v ITS2, které charakterizují celé clades nebo jednotlivé taxony byly mapovány na predikovaných sekundární struktury modelů. Morfologické vlastnosti, konstrukční údaje a fylogenetické analýzy tří datových souborů, tj. ITS, ITS-beta-tubulin a 28S-18S-rpb2-mcm7, definovat robustní clade obsahuje osm druhů Cyphellophora (včetně typu) a šest druhů Phialophora. Tyto taxony jsou nyní ubytováni v Cyphellophoraceae, nová evoluční linie v Chaetothyriales. Cyphellophora je emended a rozšířen tak, aby zahrnoval druhy, jak Septate a nonseptate conidia vytvořenou na diskrétní, interkalární, terminálu nebo boční phialides. Šest nových kombinací v Cyphellophora navrhují a dichotomické klíč k druhu přijatých v rodu je zajištěno. Cyphellophora eugeniae a C. hylomeconis, které ve sloupci Chaetothyriaceae, představují další nový rodokmen a jsou zavedeny jako typ druhů samostatných rodů. |
| Související projekty: |