Novel Evolutionary Lineages Revealed in the Chaetothyriales (Fungi) Based on Multigene Phylogenetic Analyses and Comparison of ITS Secondary Structure

Varování

Publikace nespadá pod Lékařskou fakultu, ale pod Středoevropský technologický institut. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Název česky Nové evolučními rodokmeny Odhalení v Chaetothyriales (houby) na základě analýz multigenních fylogenetických a srovnání jeho sekundární struktury
Autoři

RÉBLOVÁ M. UNTEREINER W. RÉBLOVÁ Kamila

Rok publikování 2013
Druh Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj PloS ONE
Fakulta / Pracoviště MU

Středoevropský technologický institut

Citace
www http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0063547
Doi http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0063547
Obor Onkologie a hematologie
Klíčová slova Cyphellophora and Phialophora; Chaetothyriales
Popis Cyphellophora a Phialophora (Chaetothyriales, Pezizomycota) zahrnují druh známý z kožních infekcí lidí a zvířat a z různých ekologických zdrojů. Tyto houby byly studovány na základě srovnání kulturních a morfologické rysy a fylogenetické analýzy pěti jaderných lokusů, tj. vnitřní přepisována spacer rDNA operonu (ITS), velké a malé podjednotky jaderné ribozomální DNA (rDNA nuc28S, nuc18S rDNA), beta-tubulinu , replikace DNA licencí faktor (mcm7) a druhé největší podjednotka RNA polymerázy II (rpb2). Fylogenetických výsledky byly podporovány srovnávací analýzy ITS1 a ITS2 sekundární struktury zástupců Chaetothyriales a identifikace substitucí mezi analyzovaného taxonů. Párů bází s non-konzervativních, co se vyvíjející nukleotidů, které udržují párování bází v RNA transkriptu a jedinečné evoluční motivy v ITS2, které charakterizují celé clades nebo jednotlivé taxony byly mapovány na predikovaných sekundární struktury modelů. Morfologické vlastnosti, konstrukční údaje a fylogenetické analýzy tří datových souborů, tj. ITS, ITS-beta-tubulin a 28S-18S-rpb2-mcm7, definovat robustní clade obsahuje osm druhů Cyphellophora (včetně typu) a šest druhů Phialophora. Tyto taxony jsou nyní ubytováni v Cyphellophoraceae, nová evoluční linie v Chaetothyriales. Cyphellophora je emended a rozšířen tak, aby zahrnoval druhy, jak Septate a nonseptate conidia vytvořenou na diskrétní, interkalární, terminálu nebo boční phialides. Šest nových kombinací v Cyphellophora navrhují a dichotomické klíč k druhu přijatých v rodu je zajištěno. Cyphellophora eugeniae a C. hylomeconis, které ve sloupci Chaetothyriaceae, představují další nový rodokmen a jsou zavedeny jako typ druhů samostatných rodů.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.

Další info