Detekce profágů v kmenech <I>Staphylococcus aurerus</I> pomocí druhově specifických sond
| Autoři | |
|---|---|
| Rok publikování | 2001 |
| Druh | Článek ve sborníku |
| Konference | 22nd Congress of the Czechoslovak Society for Microbiology - Health and Microorganisms |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Obor | Genetika a molekulární biologie |
| Popis | V genomech typizačních fágů S. aureus mezinárodní řady byly vy-hledány sekvence specifické pro fágové druhy séroskupin A (fág 3A), B (fág 53), F (fág 77) a L (fág 187). Hybridizační sondy připravené z těchto sekvencí detekují v lyzogenních kmenench S. aureus profágy příslušných fágových druhů. K usnadnění detekce profágů byly pro každou ze specifických sekvencí navrženy PCR-primery, umožňující získat pro každý fágový druh amplifikační produkt charakteristické velikosti. Optimalizací sady primerů byla zavedena multiplex PCR pro přímý důkaz přítomnosti profágů jednotlivých druhů v jediné PCR-reakci. Metoda detekce profágů byla ověřena jak na uměle lyzo-genizovaných kmenech připravených na našem pracovišti, tak na kmenech z klinického materiálu. S využitím této techniky byly proká-zány významné rozdíly v obsahu profágů u meticilin-rezistentních kmenů. Srovnání diskriminační schopnosti několika genotypizačních metod (PFGE, ribotypizace) prokázalo, že stanovení rozdílů v obsahu profágů představuje velmi citlivou typizační metodu, která je vhodná i pro odlišení blízce příbuzných kmenů. |
| Související projekty: |