Testování kandidátních lokusů pro typizaci klinických izolátů Treponema pallidum.

Autoři	MATĚJKOVÁ Petra FLASAROVÁ Magdalena ŠMAJS David WOZNICOVÁ Vladana
Rok publikování	2007
Druh	Článek ve sborníku
Konference	XI. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků.
Fakulta / Pracoviště MU	Lékařská fakulta
Citace
Obor	Genetika a molekulární biologie
Klíčová slova	Candidate loc; clinical testing; Treponema pallidum.
Popis	Bylo provedeno pilotní testování lokusů potenciálně využitelných k typování PCR pozitivních vzorků klinického materiálu syfilitických pacientů. Testované lokusy byly vybrány na základě mapování heterologních úseků mezi kmeny Nichols, SS14 (syfilitické kmeny) a Samoa D (kmen yaws) s využitím metody komparativní genomové sekvenace. Jednalo se o hypotetické geny TP0136 a TP0548 v genomu T. pallidum subsp. pallidum kmene Nichols. Bylo provedeno srovnání sekvencí těchto genů v klinickém materiálu s typovými kmeny T. pallidum poddruhů pallidum, pertenue a endemicum.
Související projekty:	Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum