A combined AFLP-multiplex PCR assay for molecular typing of Escherichia coli strains using variable bacterial interspersed mosaic elements
| Název česky | Kombinovaná AFLP-multiplex PCR assay pro molekulární typizaci kmenů Escherichia coli |
|---|---|
| Autoři | |
| Rok publikování | 2004 |
| Druh | Článek v odborném periodiku |
| Časopis / Zdroj | Epidemiology and Infection |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Obor | Mikrobiologie, virologie |
| Klíčová slova | AFLP-multiplex PCR; molecular typing; Escherichia coli |
| Popis | Tato nová metoda pro molekulární typizaci kmenů E. coli byla vyvinuta na základě polymorfizmu v chromozomálních sekvencích bakteriálních interspersed mosaic elements (BIMEs) detekovaných pomocí Multiplex PCR a AFLP. Využití metody v praxi bylo ověřeno na skupině 524 kmenů humánního i veterinárního původu. V této skupině bylo zjištěno 18 různých genotypů. Mezi jednotlivými genotypy byly zjištěny významné rozdíly ve frekvenci jejich výskytu u jednotlivých skupin. To ukazuje, že metoda může být slibným nástrojem v epidemiologických analýzách E. coli. |