Přejít k obsahu | Přejít k hlavnímu menu | Přejít k vyhledávání

Informace o projektu
Evoluce genomu alopolyploidních řeřišnic (Cardamine) rozdílného fylogenetického stáří

Informace

Projekt nespadá pod Lékařskou fakultu, ale pod Středoevropský technologický institut. Oficiální stránka projektu je na webu muni.cz.
Logo poskytovatele
Kód projektu
GAP501/10/1014
Období řešení
1/2010 - 12/2012
Investor / Programový rámec / typ projektu
Grantová agentura ČR
  • Standardní projekty
Fakulta / Pracoviště MU
Středoevropský technologický institut
Spolupracující organizace
Univerzita Karlova v Praze
  • Odpovědná osoba prof. RNDr. Karol Marhold, CSc.
Universität Osnabrück
  • Odpovědná osoba prof. Klaus Mummenhoff, Ph.D.
  • Odpovědná osoba Walter Bleeker
  • Odpovědná osoba Ulrike Coja

Polyploidie hraje významnou roli při speciaci semenných rostlin. Nicméně překvapivě málo je známo o stabilitě chromosomů v prvních generacích po vzniku alopolyploidů a u evolučně mladých polyploidů. Poprvé bude použita technika kombinované GISH a SMC (genomická in situ hybridizace a srovnávací malování chromosomů) u hybridních a alopolyploidních řeřišnic (Cardamine) k analýze intergenomických chromosomových interakcí. GISH identifikuje rodičovské chromosomové sady a intergenomické translokace, zatímco SMC odhalí inter- a intrachromosomové přestavby. Stabilita chromosomů bude analyzována u nedávno (ca. 100 let) vzniklého triploidního hybrida C.x insueta (2n=24) a autoalohexaploida C. schulzii (2n=48), evolučně staršího druhu C. flexuosa (2n=32), a jejich domnělých rodičovských druhů. U tří analyzovaných alopolyploidních taxonů budou etablovány syntetické linie a chromosomová stabilita monitorována v posloupných generacích. Projekt ozřejmí spojitost mezi chromosomovými přestavbami a evolucí alopolyploidních genomů rostlin.

Publikace

Počet publikací: 7

2017

  • Young inversion with multiple linked QTLs under selection in a hybrid zone

    LEE Cheng-Ruei WANG Baosheng MOJICA Julius P. MANDÁKOVÁ Terezie PRASAD Kasavajhala V. S. K. GOICOECHEA Jose Luis PERERA Nadeesha HELLSTEN Uffe HUNDLEY Hope N. JOHNSON Jenifer GRIMWOOD Jane BARRY Kerrie FAIRCLOUGH Stephen JENKINS Jerry W. YU Yeisoo KUDRNA Dave ZHANG Jianwei TALAG Jayson GOLSER Wolfgang GHATTAS Kathryn SCHRANZ M. Eric WING Rod LYSÁK Martin SCHMUTZ Jeremy ROKHSAR Daniel S. MITCHELL-OLDS Thomas

    Článek v odborném periodiku

    Nature Ecology and Evolution, rok: 2017, ročník: 1, vydání: 5, DOI

2016

2014

2013

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.

Další info