Informace o projektu
Chemická modulace aktivity Ku komplexu a využití v editaci genomů
- Kód projektu
- GA19-21961S
- Období řešení
- 3/2019 - 12/2021
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Standardní projekty
- Fakulta / Pracoviště MU
- Středoevropský technologický institut
Integrita genomu je řízena několika mechanismy, mezi kterými jsou nejsložitější dráhy zabývající se zlomenými konci DNA. Kvůli své silné vazebné aktivitě na DNA konce je Ku jednou z klíčových molekul zapojených do metabolismu DNA zlomů. Je nezbytná pro opravu DNA pomocí nehomologického koncového spojování, ale je také nezbytná pro integritu telomer.
Díky své důležité funkci při udržování genomu zkoumání Ku otevírá zajímavé možnosti v oblasti biotechnologie a medicíny. Doposud byla funkce Ku modifikována geneticky, protože nejsou k dispozici žádné chemické inhibitory. Zde navrhujeme studovat mechanismus interakce Ku-DNA s důrazem na C-terminální SAP doménu Ku70. Dále chceme provést screening chemických
knihoven k identifikaci sloučenin, které inhibují vazbu Ku na DNA. Identifikované inhibitory budou biochemicky charakterizovány a testovány na jejich biologickou aktivitu in vivo. Nakonec zjistíme, zda tyto sloučeniny ovlivňují účinnost při cílení genů a spektrum mutací indukovaných
CRISPR / Cas9 v rostlinných buňkách.
Publikace
Počet publikací: 3
2023
-
The SAP domain of Ku facilitates its efficient loading onto DNA ends
Nucleic acids research, rok: 2023, ročník: 51, vydání: 21, DOI
2021
-
A hypomorphic allele of telomerase uncovers the minimal functional length of telomeres in Arabidopsis
Genetics, rok: 2021, ročník: 219, vydání: 2, DOI
-
High-Throughput Protein-Nucleic Acid Interaction Assay Based on Protein-Induced Fluorescence Enhancement
RNA REMODELING PROTEINS, rok: 2021, počet stran: 9 s.