Informace o projektu
Proteotypová klasifikace renálního karcinomu ve vztahu k prognóze a terapeutické odpovědi
- Kód projektu
- NV19-08-00250
- Období řešení
- 5/2019 - 12/2023
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo zdravotnictví ČR
- Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu a vývoje na léta 2015 - 2022
- Fakulta / Pracoviště MU
-
Přírodovědecká fakulta
- doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D.
- Mgr. Pavla Bouchalová, Ph.D.
- Mgr. Lucia Janáčová
- Mgr. Petr Lapčík, Ph.D.
- Spolupracující organizace
-
Fakultní nemocnice Plzeň
- Odpovědná osoba prof. MUDr. Milan Hora, Ph.D., MBA
- Odpovědná osoba MUDr. Ondřej Fiala, Ph.D.
- Odpovědná osoba doc. MUDr. Alexandr Poprach, Ph.D.
- Odpovědná osoba MUDr. Alice Hlobilková, Ph.D.
- Odpovědná osoba doc. MUDr. Radek Lakomý, Ph.D.
- Odpovědná osoba MUDr. Ján Podhorec
Renální karcinom (RCC) přestavuje závažné onkologické onemocnění s celosvětově nejvyšší incidencí v České republice, přičemž spolehlivé molekulární prognostické a prediktivní biomarkery nejsou dosud k dispozici. Pro jejich “high-throughput“ vyhledávání a validaci zavedeme novou metodiku digitálního biobankingu založenou na získávání proteinových fingerprintů (proteotypů) pomocí hmotnostní spektrometrie v tzv. “data independent acquisition” módu. S využitím nově zavedené techniky budou analyzovány dva velmi dobře charakterizované soubory nádorů, získaná data budou statisticky hodnocena s cílem nalézt: (i) proteinové biomarkery identifikující pacienty s lokalizovaným RCC avšak s vyšším rizikem, kteří by měli být detailněji sledováni, a (ii) proteinové biomarkery související se špatnou odpovědí metastatických nádorů ledvin na léčbu tyrosinkinasovými inhibitory v první linii. Očekáváme, že nalezené patterny, potenciální biomarkery, resp. potenciální terapeutické cíle pomohou přispět k zefektivnění terapie pacientů s nádory ledvin.
Publikace
Počet publikací: 27
2023
-
Next generation proteomics identifies a potential protein marker of poor response to tyrosine kinase inhibitors in metastatic renal cell carcinoma
Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty
-
Proteotype classification of localized and metastatic renal cell carcinoma for prognosis and therapy response
Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty
-
Proteotype classification of metastatic and localized renal cell carcinomas for prognosis and therapy response
Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty
-
Proteotypová klasifikace renálního karcinomu
Rok: 2023, druh: Vyžádané přednášky
-
Transmembrane glycoprotein GPNMB is a potential marker of poor response of metastatic renal cell carcinoma to tyrosine kinase receptor inhibitor treatment
Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty
2022
-
A large-scale assay library for targeted protein quantification in renal cell carcinoma tissues
Proteomics, rok: 2022, ročník: 22, vydání: 7, DOI
-
Current methods for studying metastatic potential of tumor cells
Cancer Cell International, rok: 2022, ročník: 22, vydání: 1, DOI
-
DIA-MS identifies proteins associated with a poor response of metastatic renal cell carcinoma to tyrosine kinase inhibitor treatment
Rok: 2022, druh: Konferenční abstrakty
-
Characterization of the AGR2 Interactome Uncovers New Players of Protein Disulfide Isomerase Network in Cancer Cells
Molecular & Cellular Proteomics, rok: 2022, ročník: 21, vydání: 2, DOI
-
Proteiny odpovědné za špatnou terapeutickou odpověď metastatických nádorů ledvin na léčbu tyrosinkinasovými inhibitory
Rok: 2022, druh: Konferenční abstrakty